جامعة مالانج الإسلامية لها عدة كليات، وهي:
- كلية الدراسات الإسلامية
- كلية الحقوق
- كلية الزراعة
- كلية الإنتاج الحيواني
- كلية الهندسة
- كلية الرياضيات والعلوم الطبيعية
- كلية التربية والتعليم
- كلية الاقتصاد والأعمال
- كلية العلوم الإدارية
- كلية الطب
- كلية الدراسات العليا
